Modalità di presentazione
Propone strumenti di lavoro di tipo prevalentemente grafico per creare rappresentazioni della struttura atomica di molecole, anche complesse; si possono utilizzare per il disegno sia alcune forme base e template già pronti, sia tracciare liberamente linee e forme.

Modalità di input
Il programma si usa e si gestisce interamente con il mouse, ma molti comandi e menu sono attivabili anche tramite scorciatoie da tastiera, usata anche nelle attività di inserimento di formule in algebra e analisi.

Personalizzazione di grafica ed interfaccia
Sono numerose le possibilità di adattare l'interfaccia ai diversi tipi di esigenze e situazioni visive. Mantiene le personalizzazioni effettuate da sistema operativo quanto a caratteri dei menu, stile finestre e puntatore del mouse. Inoltre ha una funzione per variare lo “zoom” degli oggetti sul foglio di lavoro. Per ogni oggetto grafico creato si possono modificare lo spessore della linea, il colore e i testi (dal menu “proprietà” dell'oggetto stesso, attivabile con il tasto destro del mouse).

Tecnologie assistive
E' compatibile con l’ingranditore, che potrebbe risultare utile per la lettura di schermate complesse.