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Garlic

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Autore	Damir Zucic
Versione	2004
Pagina web del prodotto	http://www.zucic.org/garlic/index.html
Licenza	GPL

Torna su Caratteristiche didattiche
Descrizione	Software per la visualizzazione di macromolecole
Materie	Chimica, Medicina
Argomento	Biochimica
Scuole	Università
Strategia didattica	Ambiente aperto
Lingua	Inglese
Prerequisiti	Conoscenze di biologia molecolare

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Garlic è un software per la visualizzazione molecolare, che consente di rappresentare in 3D grandi molecole organiche, di ruotarle nello spazio, di ingrandirle o ridurle secondo il proprio interesse. Gli atomi appaiono come sfere e i legami di valenza come cilindri o coni allungati o, anche, come superfici curve. Sono disponibili cinque tipi di piani di sezione: planare, sferico, semisferico, cilindrico e semicilindrico. La posizione e lo spessore della sezione sono visibili in un'apposita piccola finestra. Con Garlic è possibile visualizzare anche altri oggetti come ad esempio la membrana cellulare. Oltre agli elementi chimici standard, Garlic consente di usare di due elementi immaginari, lo "jellium" (J) e il "quarkonium" (q). Questi elementi possono essere usati per disegnare alcuni oggetti speciali. Jellium non forma mai alcun legame, mentre il quarkonium può assumere valenza 0,1, o al massimo 2. Tutte le informazioni atomiche sono disponibili al solo passaggio del mouse sull'immagine. Garlic è in grado di trattare contemporaneamente più strutture molecolari. Le strutture si possono colorare secondo particolari proprietà ad esempio il loro grado di idrofobicità. Il software è in grado anche di rappresentare il diagramma di Ramachandran, la ruota elicoidale, lo schema di Venn, etc. I comandi devono essere scritti in un'apposita riga, posta in fondo alla finestra principale, in cui vengono visualizzati anche gli eventuali messaggi d'errore. Scaricabile dalla rete al seguente indirizzo: http://www.zucic.org/garlic/docs.html

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Garlic è un software per la visualizzazione molecolare, che consente di rappresentare in 3D grandi molecole organiche, di ruotarle nello spazio, di ingrandirle o ridurle secondo il proprio interesse. Gli atomi appaiono come sfere e i legami di valenza come cilindri o coni allungati o, anche, come superfici curve. Sono disponibili cinque tipi di piani di sezione: planare, sferico, semisferico, cilindrico e semicilindrico. La posizione e lo spessore della sezione sono visibili in un'apposita piccola finestra. Con Garlic è possibile visualizzare anche altri oggetti come ad esempio la membrana cellulare. Oltre agli elementi chimici standard, Garlic consente di usare di due elementi immaginari, lo "jellium" (J) e il "quarkonium" (q). Questi elementi possono essere usati per disegnare alcuni oggetti speciali. Jellium non forma mai alcun legame, mentre il quarkonium può assumere valenza 0,1, o al massimo 2. Tutte le informazioni atomiche sono disponibili al solo passaggio del mouse sull'immagine. Garlic è in grado di trattare contemporaneamente più strutture molecolari. Le strutture si possono colorare secondo particolari proprietà ad esempio il loro grado di idrofobicità. Il software è in grado anche di rappresentare il diagramma di Ramachandran, la ruota elicoidale, lo schema di Venn, etc. I comandi devono essere scritti in un'apposita riga, posta in fondo alla finestra principale, in cui vengono visualizzati anche gli eventuali messaggi d'errore. Scaricabile dalla rete al seguente indirizzo: http://www.zucic.org/garlic/docs.html

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Esperienze d'uso tratte da Essediquadro	Nessuna esperienza d'uso disponibile.
Risorse informative online	Documentazione online in inglese: http://www.zucic.org/garlic/docs.html Tutorial online in inglese: http://www.zucic.org/garlic/docs.html

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Focus accessibilità

Conformità alla Legge n. 4/2004 (Allegato D del DM Luglio 2005)

Dalla valutazione effettuata risulta che il software è conforme alla Legge per 6 requisiti su 11. In particolare sono stati rispettati i requisiti: 1, 4, 6, 9, 10, 11; non sono stati rispettati i requisiti: 2, 3, 5, 7, 8.

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Accessibilità per i vari tipi di disabilità

disabilità motoria:
Completa

ipovisione:
Nulla

cecità:
Nulla

disabilità uditiva:
Completa