SoDiLinux

Garlic  
Versione linux
Lancia il programma
 
info Caratteristiche descrizione Requisiti Linux Immagini
Sommario
Garlic è un software per la visualizzazione molecolare, che consente di rappresentare in 3D grandi molecole organiche, di ruotarle nello spazio, di ingrandirle o ridurle secondo il proprio interesse. Gli atomi appaiono come sfere e i legami di valenza come cilindri o coni allungati o, anche, come superfici curve. Sono disponibili cinque tipi di piani di sezione: planare, sferico, semisferico, cilindrico e semicilindrico. La posizione e lo spessore della sezione sono visibili in un'apposita piccola finestra. Con Garlic è possibile visualizzare anche altri oggetti come ad esempio la membrana cellulare. Oltre agli elementi chimici standard, Garlic consente di usare di due elementi immaginari, lo "jellium" (J) e il "quarkonium" (q). Questi elementi possono essere usati per disegnare alcuni oggetti speciali. Jellium non forma mai alcun legame, mentre il quarkonium può assumere valenza 0,1, o al massimo 2. Tutte le informazioni atomiche sono disponibili al solo passaggio del mouse sull'immagine. Garlic è in grado di trattare contemporaneamente più strutture molecolari. Le strutture si possono colorare secondo particolari proprietà ad esempio il loro grado di idrofobicità. Il software è in grado anche di rappresentare il diagramma di Ramachandran, la ruota elicoidale, lo schema di Venn, etc. I comandi devono essere scritti in un'apposita riga, posta in fondo alla finestra principale, in cui vengono visualizzati anche gli eventuali messaggi d'errore.
 

menu principale elenco generale
indietro
elenco per materiaelenco per scuola